آخوند روحانی در یک واکنش تأخیری و سوزناک نسبت به قطعنامه شورای حکام درباره فعال شدن پرونده پی.ام.دی گفت: آژانس می‌خواهد نبش‌قبر کند یک موضوعی که ۱۸سال پیش هست می‌گویند نظارت کن و پیدا کن، گول می‌زنند آژانس را از مسیر خودش منحرف می‌کنند.
آخوند روحانی امروز ۴تیر ۹۹ در جلسه هیات دولت با سوز و گداز نسبت به صدور قطعنامه شورای حکام علیه فعالیتهای اتمی رژیم گفت:
«و نکته آخر من هشدار به کشورهای اروپایی و آژانس هست! ما خوب رفتار ما با آژانس یک رفتار دوستانه و قانونی بوده. ... . حالا این اواخر متأسفانه رژیم صهیونیستی و آمریکایی این دو تا فشار آوردن به آژانس و من می‌ترسم که آژانس را این شیادان آلوده بکنند و آژانسی که همواره باید قضاوتش یک قضاوت دقیق باشد عادلانه باشد صحیح باشد این را وادار کردند که برود دنبال نبش قبر... .
یک موضوعی که مربوط به ۲۰سال پیش هست ۱۸سال پیش هست یک جزیی برو این را نظارت کن آن را پیدا کن دارند گول می‌زنند آژانس را از مسیر خودش منحرف می‌کنند ما البته هر وقت بخواهیم پاسخ قاطع بدهیم آسان هست برای ما پاسخ دادن اما مبنای ما همیشه همکاری بوده با آژانس امروز هم این مبنا را ما حفظ می‌کنیم همکاری با آژانس را اما خود آژانس هم باید توجه بکند از مسیر قانونی خودش منحرف نشود از آن طرف اروپایی‌ها که خوب به‌هرحال شرمنده ما هستند ... . تلفنی حضوری از ما عذرخواهی می‌کنند! به ما می‌گویند ما نتوانستیم به وظایف‌مان عمل کنیم ... . . و من در اینجا می‌گویم ایران هم‌چنان آماده است نظارتهای قانونی آژانس را بپذیرد هم‌چنان ایران آماده است با آژانس همکاری تنگاتنگ داشته باشد البته در چارچوب قانون در چارچوب مقررات.
لازم به یادآوری است که اشاره آخوند روحانی به نبش‌قبر پرونده ۱۸سال پیش، افشاگری مجاهدین و مقاومت ایران در تابستان ۱۳۸۱ پیرامون سایتهای مخفی نطنز و اراک است که شورای حکام در آخرین قطعنامه خود در هفته گذشته خواستار بازرسی از آنها شده است.
